Il Parco nazionale non è ancora dotato degli strumenti di gestione previsti dalla Legge 394/91: Regolamento del Parco, art. 11; Piano per il Parco, art. 12; Piano pluriennale economico e sociale, art. 14.
L'Ente parco ha incaricato un'associazione di imprese, con capogruppo la società Studio Silva, della redazione della documentazione relativa a questi importanti strumenti di gestione: il Piano per il Parco suddividerà il territorio in zone a differente destinazione d'uso in base al diverso grado di protezione, il Regolamento disciplinerà le attività consentite , il Piano pluriennale economico e sociale promuoverà le iniziative atte a favorire le attività socio - economiche compatibili.
I Siti di Interesse Comunitario e le zone di Protezione Speciali sono istituiti rispettivamente secondo le Direttiva 92/43/CE o Direttiva Habitat e Direttiva 2009/147/CE o Direttiva Uccelli. La denominazione dei siti è la stessa, in quanto coincidenti: ITB010008 Arcipelago La Maddalena.
Scarica qui il Piano di gestione SIC, approvato con decreto dell'Assessore Difesa dell'ambiente n. 13112/20 del 22 giugno 2017.
Scarica qui il Piano di gestione ZPS, approvato con decreto dell'Assessore Difesa dell'ambiente n. 13113/21 del 22 giugno 2017.
La cartografia allegata è disponibile sul portale SardegnaAmbiente.